O fórum/site oficial do Google anunciou que, se você não permitir que o Googlebot rastreie seus arquivos CSS e JS, seu posicionamento nos resultados de busca poderá ser afetado.

Basicamente, isso significa que, se você bloquear o Googlebot no seu arquivo robots.txt, poderá ser afetado.

Mais informações aqui:

http://www.clickthrough-marketing.com/seo-google-webmaster-guidelines-updated-says-dont-block-javascript-or-css/